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Mit über 300.000 Geldscheinen zählt die Giesecke+Devrient Stiftung Geldscheinsammlung zu den bedeutendsten Sammlungen dieser Art weltweit. Sie enthält als Generalsammlung Papiergeld aus allen Ländern und Zeiten. Als "lebende" Sammlung wird sie kontinuierlich ergänzt, d. h. alle Neuerscheinungen weltweit werden laufend für die Sammlung angekauft. Anspruch und Ziel ist es, die gesamte Entwicklung im Bereich Papiergeld zu dokumentieren.

Der 1833 gegründete Historische Verein Neuburg an der Donau ist einer der ältesten Geschichtsvereine Bayerns. Zu seinen Aufgaben zählt u.a. die Bewahrung der Zeugnisse von Geschichte und Kunst des ehemaligen Fürstentums Pfalz-Neuburg. Die noch in seiner Gründungsphase erworbenen Kernbestände umfassen Ausstattungsstücke des Schlosses Neuburg. Mit Objekten vom 15. bis zum 20. Jahrhundert zählen die Sammlungen des Vereins zu den umfangreichsten und wertvollsten in Bayern, die teils im Stadtmuseum Neuburg, teils im Neuburger Schlossmuseum zu besichtigen sind.

Die kulturellen Ausdrucksformen, die im Bayerischen Landesverzeichnis des Immateriellen Kulturerbes aufgelistet sind, sind bezeichnend für die Vielfalt des kulturellen Erbes in Bayern. Die Komplexität und Diversität der bayerischen Kultur stehen im Vordergrund. Diese Sammlung gehört zur virtuellen Ausstellung "KulturErben. Immaterielles Kulturerbe in Bayern".

Das Staatliche Textil- und Industriemuseum Augsburg (tim), das 2010 als neues Landesmuseum in der Fuggerstadt eröffnet worden ist, stellt eine Einrichtung des Freistaates Bayern dar und ist, juristisch gesprochen, eine nachgeordnete Behörde des Bayerischen Staatsministeriums für Wissenschaft und Forschung. Das ursprünglich von einem Förderverein – heute: Förder- und Freundeskreis tim – initiierte Museum ist der Geschichte der bayerischen Textilindustrie vom 18. bis zum 20. Jahrhundert gewidmet. Sein Sammlungsauftrag besteht darin, jegliche materiellen Zeugnisse dieser Industriebranche in Bayern exemplarisch zu sammeln, aufzubewahren, zu erforschen und in Ausstellungen (Dauer- und jährlichen Sonderausstellungen) und weiteren Kulturveranstaltungen der Öffentlichkeit zugänglich zu machen.

Die Botanische Staatssammlung München (SNSB-BSM) ist eine Abteilung der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB). Sie handelt als Forschungseinrichtung im Bereich Botanik/Mykologie. Ihre Sammlungskuratoren forschen in den Bereichen Evolutionsforschung, Pflanzengeographie und Systematik, molekularer Phylogenetik sowie Bio- und Geodiversitätsinformatik. Die BSM-Sammlungen umfassen rund 3,2 Millionen Einzelobjekte und sind Teil des internationalen Netzwerkes von mehr als 3.000 Herbarien.

Die zahlreichen kulturgeschichtlichen und archäologischen Ressourcen der Stadt boten in Regensburg im 20. Jahrhundert einen vielfachen Anreiz für die Errichtung von Museen, die sich der Sammlung und Bewahrung dieser Kulturgüter verschrieben haben. Aus diesem Grund wurde 1931 das ehemalige Minoritenkloster in Regensburg von der Stadt zu einem solchen Museum umgebaut.

Das 1903 auf Initiative von Oskar von Miller gegründete Deutsche Museum von Meisterwerken der Naturwissenschaft und Technik in München gehört zu den weltweit größten naturwissenschaftlich-technischen Museen und zählt jährlich rund 1,5 Millionen Besucher. Es verfügt über eine Sammlung mit über 100.000 Exponaten, darunter sowohl einzigartige Originale als auch historische Nachbauten.

Das Stadtarchiv Wasserburg am Inn bewahrt wertvolle kommunale Archivbestände und Sammlungen, die bis ins Spätmittelalter zurückreichen. Aufgrund des Umfangs der Altbestände und einer sehr dichten Überlieferung ab 1339 gilt es als eines der bedeutendsten Kommunalarchive in Altbayern.

Konrad Schieferdeckers persönliches Interesse galt dem Studium der Mykologie, Botanik sowie Numismatik und Urgeschichte der Region Hildesheim. Er veröffentlichte eine Reihe wissenschaftlicher Beiträge zu verschiedenen Themen, darunter die Beschreibungen einiger für die Wissenschaft neuer Pilze. 1963 schenkte er der Botanischen Staatssammlung München eine Sammlung fein gezeichneter Aquarelle, teils ergänzt mit Tusche- und Bleistiftzeichnungen, und wenige monochrome Aufnahmen von Mikro- und Großpilzen. Fast alle der Arten (875 Taxa) sind in Deutschland (Umgebung Hildesheim) beheimatet und kommen auch in Bayern vor.