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Vom Staatsrechtler, Politiker und Historiker Johann Georg von Lori (1723-1787) stammen bedeutende Quellensammlungen zur bayerischen Geschichte und zur Rechtsgeschichte, die zum Teil bis heute unentbehrlich sind.

Der Archivar und Historiker Franz Ludwig Baumann (1846-1915) verfasste wichtige Grundlagenwerke zur Geschichte Bayerisch-Schwabens wie die monumentale "Geschichte des Allgäus". Er war zudem Herausgeber zahlreicher mittelalterlicher Quellen und Verfasser wissenschaftlicher Abhandlungen.

Die Stadt Regensburg und das dortige Benediktinerstift St. Emmeram galten seit jeher als Hort der Wissenschaften. So finden sich in dieser Sammlung sowohl Werke aus der Staatlichen Bibliothek Regensburg als auch Manuskripte zu St. Emmeram. Präsentiert werden Aufzeichnungen und Chroniken, Abschriften von Urkunden, Verzeichnisse und Korrespondenzen u.a. von Fürstabt Frobenius Forster, Archivar Roman Zirngibl oder dem Altertumsforscher Bernhard Stark.

Das Arye Maimon-Institut für Geschichte der Juden (AMIGJ) ist eine wissenschaftliche Einrichtung der Universität Trier. Gegründet wurde es 1996/97 von Alfred Haverkamp (1937–2021), Professor für mittelalterliche Geschichte. Benannt ist es nach dem deutsch-israelischen Historiker Arye Maimon (geboren 1903 als Herbert Fischer, gest. 1988). Das AMIGJ widmet sich der Erforschung der Geschichte der Juden vornehmlich in Mittel- und Westeuropa mit Schwerpunkten im Mittelalter und in der Frühen Neuzeit.

Präsentiert werden 3-D Objekte aus dem Deutschen Medizinhistorischen Museum Ingolstadt, unter denen sich spannende Erzeugnisse der Medizin befinden wie eine Aderlass-Lanzette, ein etruskischer Terrakotta-Torso mit dargestellten inneren Organen oder die äußerst bildhafte Darstellung eines Zahnwurms, den man noch bis ins 18. Jahrhundert als Verursacher von Zahnlöchern ansah.